历史地理研究室成立于1960年，拥有一批德高望重的历史地理学专家，在历代疆域与政区、历史军事地理、历代地理文献、历史地名研究等领域均有独特的建树。第一任室主任为姚家积，以后相继为陈可畏、辛德勇、华林甫，现任主任毛双民，副主任成一农。现有在职人员6人，其中研究员1人、副研究员2人、助理研究员3人。

本室六、七十年代的任务，主要是参加了《中国历史地图集》工作和编绘《中华人民共和国历史地图集》。八十年代以来，则是完成了多项国家、院、所级重点课题，如《中华人民共和国国家历史地图集》战争图组、《中国历史地名大辞典》、《长江三峡历史地理研究》、《中国大百科全书》及《中国历史大辞典》历史地理部分（合作）、《中国地名学源流》等。目前的主要研究方向是历史军事地理研究、历史舆图研究、文化宗教地理研究、地理环境研究等。

主要获奖成果有：《中国历史地名大辞典》获首届中国出版政府奖、辛德勇《隋唐两京丛考》获本院第二届青年优秀成果一等奖、陈可畏主持的《中国史稿地图集》获国家教委优秀教材一等奖、陈可畏与杜瑜弟承担的自然科学基金项目《山西、陕西、甘肃、宁夏、内蒙古黄土高原历史时期农牧业研究》获中国科学院自然科学一等奖、华林甫著《论唐代的地名学成就》获中国史学会中国古代史优秀论文奖等。

目前本室正在进行的院、所重点项目有：《南北朝后期军事地理研究》（李万生）、《中国古代舆图绘制研究》（成一农）、《唐代道教地理》（何海燕）、《历史上桑干河流域城市地理研究》（孙靖国）、《商代地理环境研究》（张兴照）。