出版著作有《中国文明起源的比较研究》（1994年）、《中国古代文明的探索》（2005年）、《商代都邑》（2010年）、《商族起源与先商社会变迁》（2010年）、《中国古代国家的起源与王权的形成》（2013年）、《重建中国上古史的探索》（2015年）、《中国大通史•史前卷》（第一卷，2018年）、《炎黄学概论》（2021年）等。发表学术论文130余篇。在学术建树上先后提出：中国文明和国家起源路径的聚落三形态演进说、进入国家以后的“邦国—王国（三代王朝）—帝国”说、“夏商周三代王朝为复合制国家结构”说、“华夏民族因复合制国家结构而形成于夏代”说、“中华民族共同体形成于以郡县制为机制的大一统国家形态结构”说等，创建了系统而影响广泛的学术创新体系。