前身是中国科学院历史研究所第一所在1954年成立的第一研究组（即先秦史组），尹达任组长，胡厚宣任副组长，核心工作是在郭沫若指导下编辑出版《甲骨文合集》。1977年改为先秦史研究室。开展甲骨学、金文与青铜器、商周史及中国文明起源研究。中国社会科学院甲骨学殷商史研究中心、中国殷商文化学会、中国先秦史学会秘书处均设在该室。研究领域涵盖新石器时代与夏商西周春秋战国各断代，涉及中国文明起源、政治制度、历史地理、甲骨学、青铜器学等众多学科和研究领域。作为院优势学科的责任单位，主要科研任务是整理与解读殷周甲骨文与金文史料，并在此基础上推进政治制度、历史地理、文化思想等先秦史专题研究。此外，重点探索中国文明起源课题，追寻中华优秀传统文化的源头，及其对殷周与后世国家与社会之影响。历任研究室主任（组长）为胡厚宣、李学勤、周自强、杨升南、宋镇豪、徐义华。现有研究人员11名，主任刘源。代表性学术成果有《甲骨文合集》《英国所藏甲骨集》《甲骨文合集释文》《甲骨文合集补编》《中国社会科学院历史研究所藏甲骨集》《商代史》等。